1991年 ‧慈濟護專獲教育部八十年度社會教育有功團體暨個人大會之團體獎。 ‧慈濟護專獲社會大學文教基金會之「誰塑造八○年代──十年來十大企劃案」匾額。 1992年 ‧慈濟護專獲教育部81學年度評鑑新設六所專校辦學成績最優。 1996年 ‧慈濟護專獲教育部85學年度行政考核優良學校獎。 1997年 ‧慈濟護專獲行政院原住民族委員會頒發86年度「促進原住民社會發展有功團體獎」。 ‧慈濟護專環境保護社，獲行政院環境保護署頒發首屆大專院校推動環境保護有功的「社團及指導老師」、「社團幹部」績優獎。 1998年 ‧慈濟護專獲教育部頒發86年度行政考核優良學校獎狀、師資考核優良學校獎及辦學績優學校獎。 ‧慈濟護專獲教育部頒發「教育學子啟導關懷社會風氣，愛心廣被，捐血成績優異獎狀」。 ‧慈濟護專獲獲教育部頒發87年度行政考核績優學校獎、師資考核績優學校獎及辦學績優學校獎。 ‧慈濟護專承辦教育部87年度東區國技職校院博覽會獲頒發「技術及職業教育專案著有績效貢獻獎」。 2000年 ‧慈濟技術學院通過ISO9001品保認證，貝爾國際驗證公司蒞校頒證。 2001年 ‧慈濟技術學院承辦教育部第16屆全台技術及職業教育研討會獲頒發「技術及職業教育專案著有績效貢獻獎」。 ‧慈濟技術學院獲花蓮縣衛生局頒發「推展公共衛生業務嘉惠民從績效卓著感謝狀」。 ‧慈濟技術學院獲花蓮縣政府90年度托育機構評鑑，實驗托兒所成績經評定列為第一名及行政管理績優。 ‧慈濟技術學院獲行政院環保署「全台大專院校餐廳免洗餐具減量績優單位表揚」。 ‧慈濟技術學院學生宿舍三期新建工程榮獲行政院環保署「90年度全台環保優良營建工地」。 ‧慈濟技術學院附設實驗托兒所榮獲花蓮縣90年度托育機構評鑑優等。 ‧慈大實小榮獲90學年度合唱團比賽第三名。 2002年 ‧教育部91年度消費者服務績效考評，慈濟技術學院榮獲良等獎。 ‧慈濟技術學院獲教育部頒發90年度捐血成績優異獎狀。 ‧國立清華大學舉辦「全台電力溝通宣導與多媒體廣告製作」，榮獲大專組第三名、第四名及佳作獎。 ‧慈大實小開發計畫因致力環境保護措施，榮獲行政院環保署91年度「開發行為實施環境影響評估績優獎」。 ‧慈大實小以「小黑魚立大功」音樂劇，榮獲文建會主辦的「2002年兒童音樂短劇表演競賽」花東區特優獎。 ‧慈大實小榮獲92學年度特教評鑑優等。 ‧慈大實小榮獲92學年度教育部花蓮縣幼兒健身操觀摩表演賽優等。 ‧慈大附中獲2002年青輔會GYSD績優團隊。 ‧慈濟大學教職員宿舍工程榮獲花蓮縣環保局91年度優良工地青雲獎；聯合餐廳工程獲頒91年度頒優良環保工地功在環保獎。 ‧教育部舉辦「91學年度北區技職院校學生專題製作競賽」，慈濟技術學院放射系學會榮獲全台第二名以及最佳作品獎 ‧天下雜誌舉辦「319大專青年鄉鎮服務比賽」，慈濟技術學院護理系學會榮獲優勝及最佳多媒體紀錄獎。 2003年 ‧慈大實小榮獲經濟部水資源水利署評鑑「節約用水績優單位」。 ‧慈大實小以「國王的新衣」榮獲92學年度花蓮縣英語劇競賽特優獎。 ‧慈大實小以「完璧歸趙」英語劇榮獲92學年度花蓮縣政府舉辦的英語文競賽優等。 ‧慈大附中榮獲92年度行政院環保署環境影響評估績優獎。 ‧慈濟技術學院榮獲92年度經濟部節約能源績優廠商優等獎。 ‧慈濟技術學院獲教育部頒發91學年度「技術及職業教育專案著有績效貢獻良多獎」。 ‧慈濟技術學院獲花蓮縣衛生局頒發「熱心公共衛生」獎牌。 2004年 ‧慈濟技術學院獲行政院環保署「93年度推動環境保護有功學校」優等獎。 ‧慈濟技術學院附設實驗托兒所獲行政院勞工委員「92年度托兒設施、措施績優單位」表揚。 ‧慈濟技術學院附設實驗托兒所獲花蓮縣幼兒教育事業學會「93年托育機構績優興學獎」。 ‧慈大附中獲花蓮縣環保局「93年度花漾校園～校園淨化、綠美化競賽」高中職組第一名。 ‧慈大附中獲2004福特保育暨環保獎環保小尖兵類特優。 ‧台南慈濟大愛托兒所榮獲台南縣政府93年度台南縣托兒所評鑑優等。 2005年 ‧慈濟大學榮獲經濟部能源局「94年度節約能源績優廠商傑出獎」。 ‧慈濟技術學院榮獲94年度全學生音樂比賽之北區大專團體組女聲合唱甲等。 ‧慈濟大學榮獲教育部「94年度大學校院師資培育中心評鑑」之中等學校組一等。 ‧慈大附中榮獲中國輔導學會頒發94年度輔導工作績優學校。 ‧慈大附中獲行政院環境保護署評選為94年度推動環保有功學校優等獎。 ‧慈大附中宿舍新建工程獲花蓮縣環境保護局「第三屆優良工地青雲獎」第一名及「道路認養績優工地獎」。 ‧嘉義大林慈濟大愛托兒所榮獲嘉義縣社會局評鑑為「94年度各公私立幼教機構特優」。 2006年 ‧慈大附中獲教育部95年度生命教育教學策略、方法及資源徵稿競賽高中職校務運作類第二名。 2007年 ‧慈濟大學獲行政院環境保護署「清淨家園全民運動計畫」評比為績優單位，是全台大專院校唯一獲此殊榮的學校。 ‧慈濟大學健康傳播中心獲行政院衛生署疾病管制局「95年度防疫績優團體獎」。 ‧慈大實小榮獲花蓮縣教育局推薦「品格教學典範學校」，經天下雜誌專訪，內容刊登於「教出品格力」親子天下專刊。 ‧慈大實小榮獲花蓮縣第47屆國中小學科學展覽會之「生活與應用科學科」第二名、「自然科生物類」第三名和佳作，並獲頒團體獎第二名。 ‧慈大實小榮獲96年花蓮縣中小學英語話劇比賽特優、英語歌唱比賽優等。 ‧慈大實小花蓮縣國民中小學運動會游泳隊共獲十金五銀六銅等佳績。 ‧慈大實小榮獲花蓮縣「九十五學年度環境教育工作」國小甲組優等獎。 ‧慈大實小花蓮縣96年洄瀾月體育競賽游泳隊榮獲三金七銀七銅。 ‧慈大附中榮獲花蓮縣96年推動友善校園表現優異。 ‧慈大附中榮獲第八屆福特保育暨環保獎環保小尖兵綠色校園優選。 ‧慈大附中榮獲全台學生舞蹈比賽之國中民俗舞蹈團體組優等獎。 ‧慈濟大學及慈濟技術學院參加「2007年全台大專校院績優學生社團評鑑暨觀摩活動」，慈大慈青社和天文社榮獲「優等獎」，慈濟技術學院慈青社榮獲「特優獎」。 ‧「花蓮縣95年績優健康親善大使表揚活動」，慈濟技術學院榮獲團體組優等。 ‧慈濟技術學院榮獲「全台大專校院教職員桌球錦標賽」亞軍。 ‧慈濟技術學院榮獲行政院環保署「96年度事業廢棄物與再生資源清理及資源減量回收再利用績效」教育組特優獎。 ‧慈濟大學傳播學院新建工程榮獲花蓮縣環保局「第六屆優良工地青雲獎」第一名。 ‧慈濟大學社會教育推廣中心榮獲教育部頒發96年度「社教公益獎」之團體獎。 ‧慈濟大學榮獲經濟部水利署評選為「96年度節約用水績優單位」。 ‧本會榮獲教育部表揚96年度品德教育推動績優團體。 2008年 ‧慈大附中榮獲第十三屆遠哲科學趣味競賽全台總錦標冠軍。 ‧慈濟大學醫學資訊研究所與花蓮慈濟醫院神經醫學中心組成的癲癇醫療團隊，在2008年台灣癲癇醫學會年會囊括國際會議壁報論文前三名。 ‧慈濟大學、慈濟技術學院、慈大實小及台南慈濟中學等四所慈濟學校，榮獲教育部97年度品德教育績優學校，7月30日在台北國立編譯館接受教育部表揚。
	註：教育志業體歷年獲獎記錄，以「全校」或「整個系所」榮譽事蹟為主， 　　不刊登個人及社團之獲獎。